Characterization of Endometriosis biomarkers by Proteomics and Integrative Genomics

L'endométriose est une pathologie gynécologique oestrogèno-dépendante et inflammatoire caractérisée par le développement d’endomètre fonctionnel hors de la cavité utérine. Cette maladie est fréquente puisqu’il est estimé que 10% des femmes en activité génitale en seraient atteintes.Bien qu’il existe des formes asymptomatiques de l’endométriose, cette pathologie peut également entrainer des symptômes douloureux ainsi qu’une infertilité ; impactant fortement la qualité de vie des femmes atteintes d’endométriose.À ce jour, l’absence de test de dépistage non invasif fiable explique en partie que plusieurs années sont nécessaires pour diagnostiquer une endométriose. L’identification de potentiels biomarqueurs de l’endométriose représente donc un enjeu majeur pour améliorer la prise en charge.L’objectif de cette thèse est d’identifier de potentiels biomarqueurs de l’endométriose en utilisant différentes approches, parmi lesquelles la protéomique et la génomique intégrative. Les technologies « Omiques » ayant démontré leur pertinence pour la recherche et la caractérisation de marqueurs biologiques en santé humaine.Ainsi, quatre axes de recherche distincts ont été menés au cours de ce projet. Le premier correspond à une étude preuve de concept pour un test biologique afin d’identifier les femmes à risques parmi les patientes en protocole de fécondation in vitro (FIV). Le second, basé sur des méta-analyses, a permis l’identification de marqueurs génétiques (polymorphismes) prédisposant potentiellement à l’endométriose. Pour les deux derniers, nous avons essayé d’identifier des biomarqueurs de l’endométriose au niveau de l’endomètre eutopique par intégration rétrospective de données transcriptomiques et par une approche de protéomique différentielle.Ce travail collaboratif interdisciplinaire, nous a permis d’identifier des signatures moléculaires de l’endométriose aux niveaux génétique et protéique.Bien que nécessitant des analyses complémentaires, nos résultats sont prometteurs et pourraient à l’avenir permettre d’améliorer la prise en charge des patientes.