Copy number variation in pelvic endometriosis

목적: 자궁내막증은 불임, 만성골반통을 유발하는 질환으로, 병인론 중 유전적 요인이 대두 되었으며, 자궁내막증의 발병 감수성에 기여하거나 연관이 있는 유전적 소인을 유전체다형성중심으로 규명하여 유전적 소인을 밝히는데 기여하고자 한다. 방법: 25-50세 가임기 여성 중 자궁내막증 환자를 대상으로, 그 외 자궁근종이나 난조낭종 등 양성 부인과 질환으로 수술을 받는 환자 중 복강경으로 자궁내막증이 없는 것이 확인 된 환자를 대조군으로 하였다. 말초혈액을 이용하여 DNA를 추출하여 보관한 후Affimatrix SNP Chip을 이용하여 100K 또는 500K 분석을 한 뒤 copy number analysis soft ware를 통해 copy number 분석을 실시하였다. 최종적으로 결정된 41개의 영역에서 각각의 copy number variation region (CNVR) 에 대한 copy 수의 변화여부와 자궁내막증의 상관관계에 대해서 나이를 보정한 다중 로지스틱 회귀분석을 실시하였다. 검출된 CNVT은 real-time quantitative PCR (qPCR)방법을 이용하여 실험적으로 검증하였다. 결과: 연관성 분석은 발굴한 751개의 CNVR중 allele frequency가 1%이상인 41종의 CNVR을 대상으로 실시하였다. 2종의 CNVR가 자궁내막증군과정상인 군에서 p<0.05 미만의 유의한 차이를 보였다. 1q21.3의 CNVR에는 coding gene이 존재하지는 않았으며 정상 대조 군에 비해 자궁내막증 환자군에서 copy number loss CNV의 빈도가 유의하게 낮았다 (p<0.028). 1p13.3의 CNVR에는 GSTM1 유전자가 위치하며 정상 대조군에 비해 endometriosis 환자군에서 copy number gain CNV의 빈도가 유의하게 높았다 (p<0.038). Genomic qPCR결과 1q21.3의 CNV는 independent replication set에서도 유의한 차이를 나타내었다. 대조군 42명 중 20명에서 intensity ratio 0.5 이하의 결손이 나타난 반면 환자군 37명에서는 9명만이 결손을 나타내었다 (p=0.032) CNVR 1p13.3은 signal intensity ratio의 평균값은 환자군3.7 대 정상군 3.0으로 환자군에서 높았고 intensity ratio 2 이상의 copy number gain이 나타난 숫자도 환자군 37명중 19명, 정상대조군42명중 16명으로 환자군에서 높았으나 통계적 유의성은 없었다 (p=0.237). 결론: 자궁내막증 환자를 대상으로 1q21.3 와 1p13.3의 CNVR의 가능한 복제수 변이 마커를 찾아낼 수 있었다. 이에 대한 추가적인 연구로써 자궁내막증의 고위험 환자를 선별하는데 기여하게 될 것으로 사료된다.